Organizacija družbe podpira varno, učinkovito in nepretrgano izvajanje navigacijskih služb zračnega prometa, ki jih zagotavlja družba, ter ustrezno prilagodljivost in odzivnost na spremembe v okolju, v katerem posluje.
Glavna dejavnost družbe, vodenje in kontrola zračnega prometa, se izvaja v okviru treh operativnih sektorjev:
Proces usposabljanja operativnega osebja se izvaja v okviru Službe za usposabljanje operativnega osebja – Letalske šole.
Naloge, povezane z varnostjo v zračnem prometu, s certificiranjem izvajalca navigacijskih služb zračnega prometa, mednarodnimi zadevami in strateškim načrtovanjem, kakovostjo in varovanjem, informacijsko tehnologijo, odnosi z javnostjo ter tajništvom, se opravljajo v okviru kabineta direktorja.
Naloge, povezane s kadrovskimi, organizacijskimi in
pravnimi zadevami, finančno-računovodskimi zadevami, ter naloge, povezane z
investicijskim in tekočim vzdrževanjem ter javnimi naročili, se izvajajo v
okviru Sektorja za splošne zadeve.